Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4FO95754 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4FO95754 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms