Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN15O75808 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN15O75808 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN15O75808 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN15O75808 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms