Protein–RNA interactions for Protein: O75475

PSIP1, PC4 and SFRS1-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSIP1O75475 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSIP1O75475 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSIP1O75475 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSIP1O75475 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSIP1O75475 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSIP1O75475 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSIP1O75475 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms