Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F6O75461 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F6O75461 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F6O75461 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F6O75461 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F6O75461 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F6O75461 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F6O75461 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F6O75461 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F6O75461 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F6O75461 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F6O75461 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F6O75461 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F6O75461 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F6O75461 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F6O75461 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F6O75461 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F6O75461 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F6O75461 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F6O75461 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F6O75461 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F6O75461 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F6O75461 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F6O75461 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F6O75461 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F6O75461 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F6O75461 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F6O75461 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F6O75461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F6O75461 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F6O75461 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F6O75461 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F6O75461 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F6O75461 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F6O75461 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F6O75461 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F6O75461 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F6O75461 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F6O75461 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F6O75461 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F6O75461 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F6O75461 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F6O75461 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F6O75461 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F6O75461 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F6O75461 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F6O75461 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F6O75461 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F6O75461 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F6O75461 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F6O75461 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F6O75461 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F6O75461 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F6O75461 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F6O75461 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F6O75461 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F6O75461 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F6O75461 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F6O75461 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F6O75461 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F6O75461 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F6O75461 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F6O75461 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F6O75461 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F6O75461 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F6O75461 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F6O75461 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F6O75461 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms