Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTP4A3O75365 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A3O75365 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTP4A3O75365 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTP4A3O75365 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A3O75365 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A3O75365 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A3O75365 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A3O75365 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTP4A3O75365 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms