Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX3O75364 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX3O75364 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX3O75364 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITX3O75364 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX3O75364 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX3O75364 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX3O75364 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX3O75364 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITX3O75364 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITX3O75364 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITX3O75364 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX3O75364 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX3O75364 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITX3O75364 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITX3O75364 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX3O75364 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX3O75364 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITX3O75364 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX3O75364 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX3O75364 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX3O75364 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX3O75364 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITX3O75364 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITX3O75364 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX3O75364 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX3O75364 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX3O75364 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX3O75364 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX3O75364 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX3O75364 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX3O75364 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX3O75364 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX3O75364 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX3O75364 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms