Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPGDSO60760 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms