Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLIN3O60664 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLIN3O60664 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLIN3O60664 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms