Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP9O43818 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP9O43818 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP9O43818 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP9O43818 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP9O43818 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP9O43818 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP9O43818 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP9O43818 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP9O43818 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP9O43818 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP9O43818 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP9O43818 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP9O43818 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP9O43818 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP9O43818 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP9O43818 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP9O43818 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP9O43818 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP9O43818 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP9O43818 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP9O43818 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP9O43818 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP9O43818 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP9O43818 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP9O43818 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP9O43818 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP9O43818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP9O43818 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP9O43818 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP9O43818 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP9O43818 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP9O43818 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP9O43818 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP9O43818 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP9O43818 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP9O43818 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP9O43818 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP9O43818 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRP9O43818 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP9O43818 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP9O43818 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP9O43818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP9O43818 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP9O43818 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP9O43818 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP9O43818 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP9O43818 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP9O43818 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP9O43818 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP9O43818 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP9O43818 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP9O43818 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP9O43818 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP9O43818 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP9O43818 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP9O43818 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP9O43818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP9O43818 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP9O43818 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP9O43818 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP9O43818 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP9O43818 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP9O43818 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP9O43818 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP9O43818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP9O43818 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP9O43818 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP9O43818 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP9O43818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP9O43818 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP9O43818 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP9O43818 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP9O43818 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP9O43818 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP9O43818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP9O43818 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms