Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUV39H1O43463 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUV39H1O43463 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUV39H1O43463 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SUV39H1O43463 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms