Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CRXO43186 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRXO43186 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRXO43186 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRXO43186 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRXO43186 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRXO43186 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRXO43186 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRXO43186 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRXO43186 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRXO43186 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRXO43186 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRXO43186 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRXO43186 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRXO43186 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRXO43186 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRXO43186 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRXO43186 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRXO43186 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRXO43186 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRXO43186 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRXO43186 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRXO43186 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRXO43186 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRXO43186 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRXO43186 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRXO43186 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRXO43186 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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