Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CUX2O14529 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CUX2O14529 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CUX2O14529 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
CUX2O14529 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CUX2O14529 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CUX2O14529 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CUX2O14529 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CUX2O14529 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CUX2O14529 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CUX2O14529 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CUX2O14529 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CUX2O14529 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CUX2O14529 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CUX2O14529 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CUX2O14529 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CUX2O14529 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CUX2O14529 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CUX2O14529 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CUX2O14529 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CUX2O14529 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CUX2O14529 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
CUX2O14529 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
CUX2O14529 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
CUX2O14529 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
CUX2O14529 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CUX2O14529 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CUX2O14529 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
CUX2O14529 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CUX2O14529 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CUX2O14529 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CUX2O14529 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CUX2O14529 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CUX2O14529 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CUX2O14529 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CUX2O14529 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CUX2O14529 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CUX2O14529 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CUX2O14529 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CUX2O14529 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CUX2O14529 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
CUX2O14529 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
CUX2O14529 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
CUX2O14529 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
CUX2O14529 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CUX2O14529 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CUX2O14529 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CUX2O14529 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CUX2O14529 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CUX2O14529 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CUX2O14529 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CUX2O14529 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CUX2O14529 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CUX2O14529 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CUX2O14529 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CUX2O14529 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CUX2O14529 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CUX2O14529 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CUX2O14529 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CUX2O14529 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CUX2O14529 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CUX2O14529 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CUX2O14529 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CUX2O14529 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CUX2O14529 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CUX2O14529 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CUX2O14529 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CUX2O14529 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CUX2O14529 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CUX2O14529 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CUX2O14529 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CUX2O14529 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CUX2O14529 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CUX2O14529 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CUX2O14529 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CUX2O14529 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CUX2O14529 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CUX2O14529 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CUX2O14529 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CUX2O14529 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CUX2O14529 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CUX2O14529 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CUX2O14529 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
CUX2O14529 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
CUX2O14529 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CUX2O14529 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CUX2O14529 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms