Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAPO00193 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAPO00193 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAPO00193 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAPO00193 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAPO00193 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAPO00193 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAPO00193 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAPO00193 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAPO00193 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAPO00193 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAPO00193 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAPO00193 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAPO00193 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAPO00193 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAPO00193 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAPO00193 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAPO00193 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAPO00193 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAPO00193 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAPO00193 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAPO00193 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAPO00193 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAPO00193 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAPO00193 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAPO00193 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAPO00193 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAPO00193 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAPO00193 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAPO00193 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAPO00193 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAPO00193 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAPO00193 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAPO00193 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAPO00193 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAPO00193 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAPO00193 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAPO00193 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAPO00193 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAPO00193 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAPO00193 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAPO00193 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAPO00193 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAPO00193 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAPO00193 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAPO00193 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAPO00193 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAPO00193 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAPO00193 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAPO00193 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAPO00193 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAPO00193 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAPO00193 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAPO00193 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAPO00193 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAPO00193 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAPO00193 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAPO00193 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAPO00193 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAPO00193 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAPO00193 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAPO00193 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAPO00193 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAPO00193 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAPO00193 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAPO00193 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAPO00193 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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