Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCER2I3L3R5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCER2I3L3R5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCER2I3L3R5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER2I3L3R5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms