Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF839A8K0R7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF839A8K0R7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms