Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM23A6NLE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMIM23A6NLE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM23A6NLE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms