Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NDN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NDN8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NDN8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NDN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
A6NDN8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NDN8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NDN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A6NDN8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A6NDN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A6NDN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A6NDN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A6NDN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A6NDN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A6NDN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A6NDN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A6NDN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A6NDN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A6NDN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A6NDN8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A6NDN8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A6NDN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A6NDN8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A6NDN8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A6NDN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A6NDN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A6NDN8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A6NDN8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A6NDN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A6NDN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A6NDN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A6NDN8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A6NDN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A6NDN8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A6NDN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A6NDN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A6NDN8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A6NDN8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A6NDN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms