Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT1A5YKK6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT1A5YKK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT1A5YKK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT1A5YKK6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms