Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTAGE9A4FU28 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CTAGE9A4FU28 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTAGE9A4FU28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTAGE9A4FU28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTAGE9A4FU28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms