Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM72A0PK05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM72A0PK05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM72A0PK05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms