Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBE1Q9UJT0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms