Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR1EQ9GZS1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms