Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC46A3Q7Z3Q1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC46A3Q7Z3Q1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms