Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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