Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MSMPQ1L6U9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms