Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTRK3Q16288 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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