Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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