Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA5Q01523 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms