Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUSP1P28562 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms