Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN16Q9UKR8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN16Q9UKR8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms