Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms