Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 313.27□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 40.9
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TBRG4Q969Z0 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 LINC01021-201ENST00000503107 458 ntTSL 1 (best)3.73□□□□□ -1.811e-8■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 LINC01021-206ENST00000514844 667 ntTSL 1 (best)3.12□□□□□ -1.911e-8■■■■■ 40.9
TBRG4Q969Z0 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 511.25□□□□□ -0.619e-8■■■■■ 40.9
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TBRG4Q969Z0 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 518.27■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 40.8
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TBRG4Q969Z0 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.05□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 40.8
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TBRG4Q969Z0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 40.8
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TBRG4Q969Z0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 40.8
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TBRG4Q969Z0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 40.8
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TBRG4Q969Z0 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.896e-7■■■■■ 40.7
TBRG4Q969Z0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.425e-7■■■■■ 40.6
TBRG4Q969Z0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 40.6
TBRG4Q969Z0 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)23.45■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 40.6
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TBRG4Q969Z0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 40.6
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TBRG4Q969Z0 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 40.5
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TBRG4Q969Z0 SORT1-202ENST00000466471 521 ntTSL 23.32□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 40.5
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TBRG4Q969Z0 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.26□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 40.5
TBRG4Q969Z0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 40.4
TBRG4Q969Z0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 40.4
TBRG4Q969Z0 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 40.4
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TBRG4Q969Z0 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 40.1
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TBRG4Q969Z0 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 39.8
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TBRG4Q969Z0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-205ENST00000570423 568 ntTSL 418.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 39.8
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TBRG4Q969Z0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-213ENST00000574683 588 ntTSL 215.72■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-210ENST00000572814 532 ntTSL 411.46□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 AKAP1-216ENST00000575322 650 ntTSL 46.5□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 39.8
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TBRG4Q969Z0 QKI-217ENST00000545607 846 ntTSL 54.67□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 39.8
TBRG4Q969Z0 SERGEF-204ENST00000525168 342 ntTSL 35.8□□□□□ -1.483e-6■■■■■ 39.7
TBRG4Q969Z0 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 39.7
TBRG4Q969Z0 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 39.7
TBRG4Q969Z0 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 39.7
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TBRG4Q969Z0 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 39.7
TBRG4Q969Z0 RALGAPB-204ENST00000438490 4075 ntTSL 54.57□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 39.7
TBRG4Q969Z0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 39.6
TBRG4Q969Z0 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 417.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 39.6
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