Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms