Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-7P01780 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms