Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms