Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLDIP3Q9BY77 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms