Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms