Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms