Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms