Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRJQ12913 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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PTPRJQ12913 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTPRJQ12913 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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