Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OCA2Q04671 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OCA2Q04671 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OCA2Q04671 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OCA2Q04671 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OCA2Q04671 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms