Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms