Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJA8P48165 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA8P48165 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA8P48165 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA8P48165 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA8P48165 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms