Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB4P28070 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB4P28070 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms