Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSR1P21757 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSR1P21757 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSR1P21757 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSR1P21757 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms