Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms