Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH1P12830 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH1P12830 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms