Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms