Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE41Q9C0J9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms