Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHOXF2Q9BQY4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHOXF2Q9BQY4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms